20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1356 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  290  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  93.1 
 
 		 145 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  70.75 
 
 		 158 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  70.27 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  70.27 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  70.27 
 
 		 149 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  47.22 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  46.53 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  45.97 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  44.44 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  42.76 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  41.96 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  45.16 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  40.31 
 
 		 632 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  36.69 
 
 		 648 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  37.93 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  36.64 
 
 		 548 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  37.11 
 
 		 606 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.8716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  32.99 
 
 		 684 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  31.08 
 
 		 1543 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>