20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1664 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  280  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  51.11 
 
 
138 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  51.49 
 
 
140 aa  133  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  51.49 
 
 
138 aa  133  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  51.45 
 
 
142 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  51.45 
 
 
142 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  49.66 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  48.53 
 
 
141 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  45.83 
 
 
145 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  44.44 
 
 
145 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  46.77 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  45.58 
 
 
149 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  44.9 
 
 
149 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  44.76 
 
 
158 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  44.17 
 
 
632 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  39.69 
 
 
648 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  37.39 
 
 
548 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  34.91 
 
 
606 aa  63.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.8716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  39.02 
 
 
684 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  36.07 
 
 
1543 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>