19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2202 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  43.94 
 
 		 140 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  46.77 
 
 		 135 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  42.42 
 
 		 138 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  43.51 
 
 		 138 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  44.74 
 
 		 142 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  43.86 
 
 		 142 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  39.23 
 
 		 632 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  38.03 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  36.99 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  37.58 
 
 		 548 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  41.74 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  34.69 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  34.69 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  33.1 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  35.16 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  34.91 
 
 		 684 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  32.2 
 
 		 606 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.8716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>