20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3360 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  97.32 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  87.67 
 
 		 158 aa  263  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  74.32 
 
 		 148 aa  213  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  70.95 
 
 		 145 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  70.27 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  48.63 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  47.95 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  44.14 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  43.05 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  45.58 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  40.27 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  40.27 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  40.44 
 
 		 632 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  34.03 
 
 		 648 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  34.69 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  33.81 
 
 		 548 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  33.78 
 
 		 1543 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  28.8 
 
 		 606 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.8716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  29.37 
 
 		 684 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>