25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3119 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1316    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2816  hypothetical protein  30.03 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1468  hypothetical protein  30.03 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.260137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2738  hypothetical protein  30.03 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  46.15 
 
 		 632 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  45.54 
 
 		 548 aa  97.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  36.42 
 
 		 606 aa  89.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.8716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  30.77 
 
 		 684 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  37.88 
 
 		 138 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  37.88 
 
 		 138 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  37.59 
 
 		 145 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  36.69 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  39.69 
 
 		 135 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  36.62 
 
 		 148 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  32.88 
 
 		 158 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  34.03 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  38.94 
 
 		 142 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  38.94 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  32.82 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  23.85 
 
 		 600 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  35.59 
 
 		 141 aa  62.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  35.16 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3052  putative membrane protein, phage K related  20.08 
 
 		 574 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00556585  hitchhiker  0.0000266051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  27.35 
 
 		 1543 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>