20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1633 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  98.55 
 
 
138 aa  279  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  72.26 
 
 
140 aa  205  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  51.11 
 
 
135 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  48.25 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  47.95 
 
 
148 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  47.95 
 
 
149 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  46.53 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  46.58 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  46.81 
 
 
145 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  49.18 
 
 
142 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  49.18 
 
 
142 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  42.42 
 
 
207 aa  100  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  48.72 
 
 
141 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  41.86 
 
 
632 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  37.88 
 
 
648 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  36.67 
 
 
548 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  39.82 
 
 
606 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.8716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  36.36 
 
 
684 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  30.99 
 
 
1543 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>