20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3921 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  290  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  93.1 
 
 
145 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  73.97 
 
 
158 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  70.27 
 
 
148 aa  207  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  70.95 
 
 
149 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  70.95 
 
 
149 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  47.55 
 
 
138 aa  120  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  46.81 
 
 
138 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  43.75 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  45.83 
 
 
135 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  47.15 
 
 
142 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  42.66 
 
 
142 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  41.96 
 
 
140 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  42.97 
 
 
632 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  37.59 
 
 
648 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  38.03 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  37.4 
 
 
548 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  32.82 
 
 
606 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.8716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  30.4 
 
 
684 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  33.11 
 
 
1543 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>