22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1462 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  97.18 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  48.57 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  51.45 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  46.31 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  44.76 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  45.97 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  47.15 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  41.45 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  50 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  40.27 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  49.18 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  40.27 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  39.69 
 
 		 632 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  44.74 
 
 		 207 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  37.9 
 
 		 548 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  38.94 
 
 		 648 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  33.93 
 
 		 606 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.8716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  36.59 
 
 		 684 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1573  hypothetical protein  34.15 
 
 		 415 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.864803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  29.25 
 
 		 1543 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0790  hypothetical protein  29.91 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>