18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0566 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 200 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  45.93 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  45.1 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1808  putative transmembrane protein  39.39 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.849383  hitchhiker  0.00211486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  36.23 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.359279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  36.7 
 
 		 968 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.13 
 
 		 677 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4138  hypothetical protein  30.14 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000136425  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0595  hypothetical protein  28.82 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3902  hypothetical protein  29.45 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0303474  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  40.48 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  36.11 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  29.91 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  38.04 
 
 		 224 aa  45.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  33.33 
 
 		 630 aa  45.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  33.01 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>