12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0474 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0474  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.359279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0595  hypothetical protein  47.5 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3902  hypothetical protein  45.81 
 
 		 339 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0303474  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4138  hypothetical protein  45.81 
 
 		 191 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000136425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  34.19 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1808  putative transmembrane protein  36.02 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.849383  hitchhiker  0.00211486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  31.61 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  28.85 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.34 
 
 		 677 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  30.53 
 
 		 968 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  31.88 
 
 		 179 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>