19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3521 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  58.13 
 
 		 200 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  43.64 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  49.44 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8186  hypothetical protein  98.88 
 
 		 90 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1808  putative transmembrane protein  45.93 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.849383  hitchhiker  0.00211486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0474  hypothetical protein  33.99 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.359279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  39.82 
 
 		 968 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.25 
 
 		 677 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  37.27 
 
 		 566 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0595  hypothetical protein  29.09 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  40.96 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  29.75 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  39.74 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  29.2 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  39.78 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4138  hypothetical protein  28.69 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000136425  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3902  hypothetical protein  28.69 
 
 		 339 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0303474  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  33.75 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>