36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18641 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18641  endolysin  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  71.17 
 
 		 207 aa  254  8e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  72.26 
 
 		 222 aa  244  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  59.75 
 
 		 266 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  54.39 
 
 		 239 aa  184  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  55 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  36.42 
 
 		 158 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  33.15 
 
 		 630 aa  85.1  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  36.42 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  35.76 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  35.76 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  36.03 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  37.93 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  33.77 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  38.41 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  35.42 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  33.33 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  33.87 
 
 		 347 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  32.05 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  33.81 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  31.41 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  33.81 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  34.52 
 
 		 96 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  33.08 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  29.17 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  36 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  39.78 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  35.19 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  33.33 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1808  putative transmembrane protein  42.31 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.849383  hitchhiker  0.00211486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 244 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.974196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  27.34 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  25.6 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 271 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>