37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1036 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  69.42 
 
 		 222 aa  295  4e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  71.17 
 
 		 194 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  61.04 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  60.65 
 
 		 266 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  59.74 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  37.23 
 
 		 158 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  36.36 
 
 		 630 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  36.96 
 
 		 158 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  36.23 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  36.23 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  33.95 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  35.77 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  39.23 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  36.29 
 
 		 347 aa  74.7  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  36.11 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  34.03 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  38.64 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  32.03 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  32.03 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  30.13 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  33.09 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  37.21 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  38.83 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  29.3 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  28.99 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.974196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  31.68 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  28.78 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1808  putative transmembrane protein  36.79 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.849383  hitchhiker  0.00211486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  28.21 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  39.74 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  39.74 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  29.91 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>