31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1700 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  100 
 
 		 163 aa  330  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  62.66 
 
 		 162 aa  200  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  64.83 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  64.58 
 
 		 158 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  63.89 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  63.19 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  63.19 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  55.69 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  56.38 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  51.53 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  51.53 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  53.5 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  51.59 
 
 		 163 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  51.66 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  52.41 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  70.89 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  45.62 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  64.79 
 
 		 76 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  37.66 
 
 		 274 aa  89  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  34.27 
 
 		 630 aa  87.8  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  34.62 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  65.08 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  36.81 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  37.06 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  34.03 
 
 		 207 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  33.33 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  36.11 
 
 		 266 aa  67.8  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  35.66 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  22.66 
 
 		 237 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  28.86 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>