34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3944 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  100 
 
 		 347 aa  720    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  45 
 
 		 274 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  37.18 
 
 		 163 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  36.17 
 
 		 158 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  38.1 
 
 		 165 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  34.72 
 
 		 158 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  38.1 
 
 		 165 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  34.75 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  34.75 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  34.62 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  34.04 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  35.38 
 
 		 630 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  36.23 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  35.76 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  36.29 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  33.76 
 
 		 162 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  34.93 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  32.5 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  37.1 
 
 		 222 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  32.67 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  36.24 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  33.87 
 
 		 194 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  29.94 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  31.88 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.974196 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  31.91 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  39.29 
 
 		 96 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  30.95 
 
 		 266 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  35.63 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  28.68 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  27.61 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  28.26 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>