17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00141 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  63.75 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  64.79 
 
 		 163 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  56.76 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  51.95 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  59.09 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  59.09 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  57.58 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  56.06 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  56.06 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  50 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  46.84 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  43.59 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  45.45 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  45.45 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  44.07 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>