24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4318 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 243 aa  503  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  75 
 
 		 225 aa  344  6e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  68.51 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  63.53 
 
 		 244 aa  239  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.974196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  62.07 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  45.58 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  30.82 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  28.99 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  28.95 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  28.99 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  24.52 
 
 		 161 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  27.61 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  28.29 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  28.99 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  26.95 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  25 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  28.79 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  31.76 
 
 		 630 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  35.9 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  28.03 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  28.03 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  28.03 
 
 		 163 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  28.86 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  25.43 
 
 		 163 aa  42  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>