29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1526 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  100 
 
 
163 aa  339  8e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  81.6 
 
 
163 aa  282  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  70.55 
 
 
165 aa  250  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  70.62 
 
 
165 aa  248  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  59.09 
 
 
173 aa  187  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  53.94 
 
 
158 aa  157  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  55.48 
 
 
158 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  55.84 
 
 
158 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  55.19 
 
 
158 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  55.19 
 
 
158 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  53.8 
 
 
162 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  53.5 
 
 
163 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  49.65 
 
 
161 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  47.68 
 
 
179 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  42.26 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  37.18 
 
 
347 aa  87  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  33.99 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  52.58 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  37.14 
 
 
630 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  54.69 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  31.41 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  30.13 
 
 
207 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  30.38 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  43.59 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  28.21 
 
 
224 aa  47.4  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  28.03 
 
 
266 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  28.22 
 
 
239 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 
243 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>