29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0252 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  100 
 
 		 96 aa  202  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  96.51 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  95.35 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  91.86 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  90.7 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  90.7 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  60 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  70.89 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  58.82 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  52.58 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  47.57 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  54.55 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  51.61 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  51.61 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  59.09 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  45.98 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  39.77 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  42.86 
 
 		 630 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  37.21 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  37.21 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  39.29 
 
 		 347 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  33.33 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  34.52 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  32.53 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  30.12 
 
 		 239 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  33.33 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  33.33 
 
 		 225 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>