32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2276 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  100 
 
 		 158 aa  330  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  89.87 
 
 		 158 aa  299  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  87.97 
 
 		 158 aa  295  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  86.71 
 
 		 158 aa  290  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  86.71 
 
 		 158 aa  290  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  68.28 
 
 		 162 aa  207  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  64.83 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  95.35 
 
 		 96 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  55.48 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  54.27 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  54.27 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  51.01 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  55.97 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  52.86 
 
 		 179 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  51.61 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  49.36 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  39.26 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  43.51 
 
 		 630 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  38.24 
 
 		 222 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  59.09 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  36.03 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  34.04 
 
 		 347 aa  80.9  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  35.77 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  56.76 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  32.5 
 
 		 224 aa  77.4  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  31.79 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  35.04 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  31.25 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 243 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  29.13 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  27.63 
 
 		 204 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.974196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>