31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0209 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  568  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  45 
 
 
347 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  37.66 
 
 
163 aa  89.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  36.71 
 
 
173 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  42.45 
 
 
165 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  42.45 
 
 
165 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  35.1 
 
 
163 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  37.41 
 
 
150 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  36.69 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  33.99 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  34.1 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  33.99 
 
 
163 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  31.75 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  36.36 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  35.82 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  33.77 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  35.77 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  36.43 
 
 
158 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  35.04 
 
 
158 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  32.21 
 
 
630 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  36.43 
 
 
158 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  35.46 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  30.92 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  31.17 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  29.94 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  27.78 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  41.79 
 
 
99 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  25.9 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  29.88 
 
 
204 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  34.48 
 
 
96 aa  42.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>