34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1848 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  42.77 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  42.77 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  42.26 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  43.95 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  45.62 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  38.79 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  39.26 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  40.88 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  40 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  38.18 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  38.18 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  45.1 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  38.79 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  50.55 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  39.16 
 
 		 630 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  38.46 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  35.1 
 
 		 274 aa  84.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  35.42 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  32.67 
 
 		 347 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  36.11 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  35.03 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  40.22 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  39.13 
 
 		 266 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  53.12 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  36.96 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  33.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  36.78 
 
 		 200 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2624  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0305196  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0481  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  34.94 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  32.53 
 
 		 225 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  33.71 
 
 		 244 aa  40.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.974196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>