28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2416 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 173 aa  359  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  62.18 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  62.18 
 
 		 165 aa  201  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  59.09 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  59.09 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  55.69 
 
 		 163 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  51.97 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  51.32 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  51.32 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  50.63 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  51.32 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  49.37 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  49.36 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  47.68 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  47.71 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  43.95 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  36.71 
 
 		 274 aa  88.6  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  35 
 
 		 630 aa  77.8  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  34.93 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  45.98 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  56.45 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  35 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  32.45 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  32.14 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  31.13 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  36.27 
 
 		 266 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  33.33 
 
 		 239 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>