19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00139 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00139  endolysin  100 
 
 		 99 aa  197  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  73.02 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  59.09 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  60.61 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  65.08 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  56.06 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  56.06 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  56.06 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  56.06 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  55.56 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  55.38 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  54.69 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  53.12 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  57.89 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  56.45 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  53.12 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  41.79 
 
 		 274 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  47.06 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  37.5 
 
 		 347 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>