27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3045 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  100 
 
 
165 aa  343  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  98.79 
 
 
165 aa  338  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  70.62 
 
 
163 aa  248  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  73.42 
 
 
163 aa  248  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  62.18 
 
 
173 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  56.1 
 
 
158 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  55.49 
 
 
158 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  55.49 
 
 
158 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  54.27 
 
 
158 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  55.62 
 
 
158 aa  153  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  51.53 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  54.43 
 
 
162 aa  150  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  53.74 
 
 
161 aa  144  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  46.36 
 
 
150 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  42.77 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  44.74 
 
 
179 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  37.33 
 
 
630 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  42.45 
 
 
274 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  38.1 
 
 
347 aa  85.1  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  51.61 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  55.56 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  32.03 
 
 
207 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  33.81 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  29.8 
 
 
222 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0481  hypothetical protein  39.06 
 
 
289 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2624  hypothetical protein  39.06 
 
 
289 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0305196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>