29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1047 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  79.73 
 
 		 239 aa  359  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  71.22 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  61.04 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  59.62 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  55 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  35.48 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  33.11 
 
 		 158 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  32.5 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  34.46 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  32.43 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  33.57 
 
 		 630 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  37.06 
 
 		 163 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  40.22 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  32.26 
 
 		 162 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  35.71 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  31.91 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  29.94 
 
 		 274 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  39.22 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  32.53 
 
 		 96 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  31.13 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  28.21 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  29.94 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  38.04 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  30.53 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  33.75 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>