22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1025 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2206  hypothetical protein  97.43 
 
 		 467 aa  824    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1247    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1247    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2301  hypothetical protein  94.61 
 
 		 464 aa  814    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  95.71 
 
 		 629 aa  1108    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  25.2 
 
 		 669 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  23.92 
 
 		 669 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  29.55 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  26.15 
 
 		 632 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  24.21 
 
 		 677 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  21.88 
 
 		 824 aa  67  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  26.79 
 
 		 540 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3643  hypothetical protein  25.81 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1985  hypothetical protein  25.12 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3084  Lytic transglycosylase catalytic  23.03 
 
 		 623 aa  57.8  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  33.74 
 
 		 756 aa  55.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  20.08 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  25.75 
 
 		 605 aa  53.5  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  27.46 
 
 		 1297 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  27.71 
 
 		 828 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1236  hypothetical protein  23.3 
 
 		 523 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  22.75 
 
 		 738 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>