15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2612 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2612  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  797    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1043  hypothetical protein  37.99 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  26.86 
 
 		 351 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  32.2 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  37.1 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  38.33 
 
 		 671 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  37.5 
 
 		 646 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  42.45 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  43.33 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  33.73 
 
 		 666 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 667 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  30.16 
 
 		 179 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  35.23 
 
 		 196 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  29.37 
 
 		 168 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  29.22 
 
 		 214 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>