16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1811 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  38.86 
 
 
248 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  41.85 
 
 
666 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  35.85 
 
 
646 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  37.74 
 
 
657 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  35.98 
 
 
671 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  37.44 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  31.11 
 
 
351 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1043  hypothetical protein  28.9 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2612  hypothetical protein  43.33 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.88 
 
 
667 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2781  hypothetical protein  29.73 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  34.62 
 
 
435 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.5 
 
 
260 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  31.46 
 
 
292 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  27.18 
 
 
166 aa  42.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>