40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5524 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 196 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  50.86 
 
 		 358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  43.81 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  48.81 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  38.5 
 
 		 324 aa  148  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  41.36 
 
 		 242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  36.63 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  41.76 
 
 		 267 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  41.76 
 
 		 267 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  41.76 
 
 		 267 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  42.01 
 
 		 231 aa  131  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  42.05 
 
 		 252 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  43.79 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  46.24 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  38.25 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  36.16 
 
 		 503 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  34.98 
 
 		 503 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  37.5 
 
 		 283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  35.76 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  36.05 
 
 		 465 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2612  hypothetical protein  35.23 
 
 		 390 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  33.72 
 
 		 351 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  36.78 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.97 
 
 		 667 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.65 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  36.56 
 
 		 657 aa  45.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  31.87 
 
 		 646 aa  43.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  32.94 
 
 		 671 aa  43.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  29.89 
 
 		 280 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  28.85 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  30.77 
 
 		 300 aa  41.2  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  32.22 
 
 		 666 aa  41.2  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  27.54 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>