16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3491 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3491  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.599157  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3135  hypothetical protein  98.94 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  0.0523709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2457  hypothetical protein  66.08 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148362  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2781  hypothetical protein  43.81 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302507  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.51 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  35.39 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.97 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  40.51 
 
 		 715 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2317  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  36.59 
 
 		 672 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1692  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.29 
 
 		 664 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.05 
 
 		 687 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  27.19 
 
 		 646 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  44 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  35.62 
 
 		 435 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  37.8 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1984  hypothetical protein  29.66 
 
 		 333 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00235757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>