43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1692 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1692  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 		 664 aa  1345    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2317  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  84.19 
 
 		 672 aa  1102    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  36.43 
 
 		 687 aa  349  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.12 
 
 		 260 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  53.71 
 
 		 715 aa  177  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3633  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  38.16 
 
 		 641 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2175  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.05 
 
 		 624 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1445  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.36 
 
 		 644 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0212  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.41 
 
 		 418 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.19 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.03 
 
 		 426 aa  87.8  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2630  hypothetical protein  52.94 
 
 		 266 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  30.81 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2282  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  23.11 
 
 		 641 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.169822 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0249  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  35.56 
 
 		 189 aa  50.8  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3051  negative regulator of AmpC, AmpD  33.04 
 
 		 234 aa  50.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.8874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1984  hypothetical protein  27.32 
 
 		 333 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00235757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1458  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.17 
 
 		 275 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3135  hypothetical protein  35.29 
 
 		 282 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  0.0523709 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3491  hypothetical protein  35.29 
 
 		 282 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.599157  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2906  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.83 
 
 		 252 aa  48.5  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4242  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  24.24 
 
 		 276 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.26707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2867  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.36 
 
 		 253 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0115  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.98 
 
 		 252 aa  47.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0625458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0663  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  23.7 
 
 		 188 aa  47.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2018  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.75 
 
 		 251 aa  47.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  36.89 
 
 		 257 aa  47.4  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6183  1 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.25 
 
 		 283 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2088  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  33.33 
 
 		 224 aa  47.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.841917  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1270  negative regulator of AmpC, AmpD  38.96 
 
 		 289 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  36.92 
 
 		 292 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2607  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.36 
 
 		 253 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1042  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.48 
 
 		 283 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.09 
 
 		 241 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.05 
 
 		 265 aa  45.8  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2350  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.53 
 
 		 304 aa  45.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.53 
 
 		 260 aa  45.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2104  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.14 
 
 		 254 aa  45.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.312946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2224  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.04 
 
 		 219 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2185  negative regulator of AmpC, AmpD  39.44 
 
 		 289 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3403  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.44 
 
 		 288 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0566227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3680  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.57 
 
 		 243 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86041  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2783  hypothetical protein  30.56 
 
 		 212 aa  44.3  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>