38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2861 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  100 
 
 
459 aa  937    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  43.02 
 
 
484 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  46.21 
 
 
464 aa  345  8e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  44.63 
 
 
457 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  40.62 
 
 
459 aa  308  9e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  39.74 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  34.42 
 
 
666 aa  261  3e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  35.22 
 
 
442 aa  253  7e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  34.55 
 
 
657 aa  236  6e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  31.62 
 
 
671 aa  223  6e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  35.41 
 
 
452 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  30.53 
 
 
421 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  33.87 
 
 
461 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  34.58 
 
 
477 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  29.55 
 
 
646 aa  191  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  34.58 
 
 
477 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  34.58 
 
 
477 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  34.58 
 
 
477 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  34.58 
 
 
478 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  34.07 
 
 
399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  29.68 
 
 
532 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  27.3 
 
 
444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  27.91 
 
 
448 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  27.91 
 
 
448 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  28.98 
 
 
531 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  31.51 
 
 
519 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  26.71 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  26.15 
 
 
479 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  25.79 
 
 
470 aa  90.5  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  24.62 
 
 
470 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  24.29 
 
 
459 aa  86.7  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  31.47 
 
 
1101 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  30.83 
 
 
170 aa  50.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  32 
 
 
256 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  30 
 
 
271 aa  47  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  34.09 
 
 
175 aa  45.8  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  31.63 
 
 
240 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  24 
 
 
234 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>