35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0991 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  100 
 
 		 459 aa  942    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  40.96 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 459 aa  308  9e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  37.85 
 
 		 457 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  38.57 
 
 		 461 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  35.32 
 
 		 666 aa  262  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  36.34 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  32.7 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  34.93 
 
 		 452 aa  256  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  34.81 
 
 		 657 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  33.42 
 
 		 421 aa  211  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  34.71 
 
 		 671 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  31.55 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  28.28 
 
 		 646 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  30.21 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  33.79 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  34.57 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  29.94 
 
 		 477 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  29.73 
 
 		 477 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  29.94 
 
 		 477 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  29.43 
 
 		 448 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  29.5 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  30.87 
 
 		 519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  32.86 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  26.67 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  28.18 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  28.62 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  28.92 
 
 		 479 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  28.12 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 1101 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  27.37 
 
 		 385 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  29.06 
 
 		 216 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>