53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1403 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  100 
 
 		 484 aa  981    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  58.25 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 459 aa  359  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  43.45 
 
 		 457 aa  333  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  30.55 
 
 		 442 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  33.41 
 
 		 666 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  35.8 
 
 		 452 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  35.47 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  29.89 
 
 		 532 aa  206  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  32.6 
 
 		 657 aa  203  7e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  27.21 
 
 		 646 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  31.7 
 
 		 671 aa  196  6e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  33.25 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  28.17 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  30.7 
 
 		 519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  34.86 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 448 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  34.81 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  34.56 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  34.56 
 
 		 478 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  34.25 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  34.25 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  27.76 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  30.23 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  25.86 
 
 		 427 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  25.58 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  22.86 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  30.14 
 
 		 1101 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  30.51 
 
 		 256 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  32.23 
 
 		 271 aa  55.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.26 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  34.83 
 
 		 257 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  29.67 
 
 		 385 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  29.09 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  31.45 
 
 		 341 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.63 
 
 		 265 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  31.71 
 
 		 231 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  28.85 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  28.26 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  31.71 
 
 		 231 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  33.33 
 
 		 217 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  28.21 
 
 		 202 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 535 aa  44.3  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 175 aa  43.9  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.57 
 
 		 176 aa  43.5  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  32.63 
 
 		 267 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 210 aa  43.1  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  30.58 
 
 		 257 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>