81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04246 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  100 
 
 		 470 aa  930    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  53.18 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  39.35 
 
 		 470 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 427 aa  259  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  25.56 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  28.14 
 
 		 459 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  28.7 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  28.62 
 
 		 459 aa  93.6  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  26.84 
 
 		 464 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  25.79 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  26.68 
 
 		 461 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  28.2 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  28.9 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  24.14 
 
 		 646 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  29.26 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  27.27 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  23.29 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  26.86 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  28.01 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  26.95 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  27.4 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  27.4 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  27.05 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  26.43 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  25.61 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  25.95 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  26.42 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  28.86 
 
 		 1101 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  21.88 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  21.77 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  21.68 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  21.09 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 250 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  30.11 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  27.94 
 
 		 342 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 535 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  29.55 
 
 		 333 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  29.55 
 
 		 333 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  37.11 
 
 		 240 aa  50.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  28.07 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  25.24 
 
 		 259 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  28.07 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  29.55 
 
 		 333 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  29.55 
 
 		 333 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  28.51 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  27.63 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  28.65 
 
 		 342 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  35.65 
 
 		 170 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  30.84 
 
 		 260 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  27.87 
 
 		 295 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 202 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  29.91 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  32.98 
 
 		 349 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.3 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  33 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.05 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.11 
 
 		 261 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  33.66 
 
 		 259 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  33.68 
 
 		 256 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 210 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  26.55 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 294 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  26.48 
 
 		 281 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  37.89 
 
 		 329 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  46.94 
 
 		 295 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  43.1 
 
 		 225 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 162 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  50 
 
 		 279 aa  43.9  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  29.03 
 
 		 257 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  43.9  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  25.43 
 
 		 312 aa  43.5  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  43.4 
 
 		 325 aa  43.5  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 335 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  26.55 
 
 		 234 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  26.55 
 
 		 234 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  26.55 
 
 		 234 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 319 aa  43.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>