34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1599 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  100 
 
 		 459 aa  934    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  44.42 
 
 		 464 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  42.17 
 
 		 457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  37.12 
 
 		 459 aa  270  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  36.34 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  31.88 
 
 		 666 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  37.53 
 
 		 461 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  33.11 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  27.05 
 
 		 442 aa  206  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  27.15 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  32.7 
 
 		 646 aa  182  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  30.38 
 
 		 671 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  27.53 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  29.79 
 
 		 657 aa  169  8e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  29.7 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  32.52 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  29.19 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  29.44 
 
 		 477 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  29.19 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  28.93 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  26.02 
 
 		 531 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  28.04 
 
 		 532 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  26.94 
 
 		 519 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  27.36 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  28.68 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  22.88 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  22.76 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  31.85 
 
 		 1101 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  31.76 
 
 		 175 aa  43.9  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 333 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>