47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1095 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  100 
 
 		 442 aa  907    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  31.84 
 
 		 484 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 666 aa  278  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  30.86 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  36.24 
 
 		 646 aa  263  4e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  32.7 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  35.22 
 
 		 459 aa  253  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  32.65 
 
 		 657 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  30.96 
 
 		 671 aa  241  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  28.24 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  30.65 
 
 		 421 aa  217  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 461 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  28.08 
 
 		 459 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  29.25 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  29.25 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  28.27 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  31.29 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  26.65 
 
 		 532 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  28.66 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  28.66 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  24.86 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  24.65 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  28.34 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  28.34 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  28.34 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  27.02 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  24.83 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  22.03 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  22.07 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  33.91 
 
 		 1101 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  21.09 
 
 		 470 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1088  cell wall-associated hydrolase  30.69 
 
 		 250 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.96576  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19631  hypothetical protein  27.87 
 
 		 250 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.333076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  31.2 
 
 		 232 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  27.73 
 
 		 170 aa  50.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  26.21 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  25.16 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 231 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16421  hypothetical protein  27.52 
 
 		 250 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  34.57 
 
 		 231 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23421  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  29.47 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  32.18 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0340  hypothetical protein  46.51 
 
 		 242 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.979493  normal  0.0626014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 173 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.84 
 
 		 261 aa  43.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>