35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1181 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  98.53 
 
 
478 aa  985    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  97.9 
 
 
477 aa  980    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  98.32 
 
 
477 aa  978    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  100 
 
 
477 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  98.53 
 
 
477 aa  982    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  40.75 
 
 
519 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  41.49 
 
 
531 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  40.82 
 
 
532 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  34.58 
 
 
459 aa  190  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  29.94 
 
 
459 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  32.78 
 
 
464 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  34.71 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  34.25 
 
 
484 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  30.88 
 
 
657 aa  160  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  29.17 
 
 
421 aa  156  6e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  29.44 
 
 
459 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  32.01 
 
 
461 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  32.74 
 
 
671 aa  152  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  30.4 
 
 
666 aa  147  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  26.74 
 
 
448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  28.66 
 
 
442 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  26.67 
 
 
448 aa  144  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  26.49 
 
 
444 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  29.49 
 
 
399 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  27.9 
 
 
452 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  28.82 
 
 
646 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  27.72 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  27.18 
 
 
479 aa  85.1  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  25.17 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  27.4 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  20.73 
 
 
459 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  32.86 
 
 
1101 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  27.91 
 
 
216 aa  43.9  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  35.87 
 
 
419 aa  43.1  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  37.11 
 
 
329 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>