60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2724 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  100 
 
 		 457 aa  924    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 459 aa  341  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  43.79 
 
 		 484 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  43.29 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  37.85 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  31.72 
 
 		 666 aa  253  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  33.92 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  28.24 
 
 		 442 aa  231  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  28.67 
 
 		 657 aa  223  8e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  33.26 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  28.07 
 
 		 671 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  32 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  27.61 
 
 		 646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  25.94 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  31.03 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  34.28 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  34.71 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  34.36 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  34.02 
 
 		 477 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  34.36 
 
 		 477 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  34.02 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  23.24 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  22.98 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  22.72 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 427 aa  90.9  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  29.26 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  24.2 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  22.04 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 1101 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  29.75 
 
 		 256 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  32.23 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  34.38 
 
 		 234 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.35 
 
 		 261 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  29.46 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  26.19 
 
 		 232 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  31.62 
 
 		 225 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  36.05 
 
 		 257 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  31.9 
 
 		 231 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0340  hypothetical protein  29.92 
 
 		 242 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.979493  normal  0.0626014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  34.83 
 
 		 232 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  27.67 
 
 		 202 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  24.83 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 231 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  31.31 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  31.63 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  34.83 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 173 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  28.42 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  30.12 
 
 		 524 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 259 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  30.6 
 
 		 337 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  32 
 
 		 333 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  27.45 
 
 		 170 aa  43.5  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  32 
 
 		 333 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  32 
 
 		 333 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  30.3 
 
 		 333 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>