46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0970 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  99.33 
 
 
448 aa  900    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  96.15 
 
 
444 aa  865    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  100 
 
 
448 aa  905    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  37.24 
 
 
657 aa  302  8.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  38.58 
 
 
421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  37.1 
 
 
671 aa  282  9e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  37.53 
 
 
646 aa  276  4e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  29.66 
 
 
666 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  29.25 
 
 
442 aa  191  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  29.43 
 
 
459 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  26.92 
 
 
484 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  25.23 
 
 
452 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  28.46 
 
 
459 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  27.91 
 
 
459 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  23.46 
 
 
464 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  22.98 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  25.56 
 
 
477 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  26.22 
 
 
477 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  28.53 
 
 
477 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  26.89 
 
 
478 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  26.67 
 
 
477 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  26.05 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  25.58 
 
 
461 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  24.31 
 
 
531 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  24.26 
 
 
519 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  22.07 
 
 
532 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  25.07 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  27.22 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  25.17 
 
 
470 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  26.42 
 
 
1101 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  21.88 
 
 
470 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  22.74 
 
 
479 aa  60.1  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.53 
 
 
556 aa  50.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  28.43 
 
 
256 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  26.18 
 
 
536 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
385 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  27.78 
 
 
532 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  26.98 
 
 
532 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  29.27 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
333 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.71 
 
 
261 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  32.56 
 
 
174 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  36.23 
 
 
335 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  27.72 
 
 
271 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  31.33 
 
 
535 aa  43.5  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  30.21 
 
 
250 aa  43.5  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>