60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6627 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  100 
 
 		 1101 aa  2209    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0687  hypothetical protein  41.37 
 
 		 659 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.693872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0716  hypothetical protein  40.81 
 
 		 595 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2672  hypothetical protein  30.18 
 
 		 584 aa  124  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3206  hypothetical protein  28.54 
 
 		 566 aa  110  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 459 aa  92.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  31.47 
 
 		 459 aa  87  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 448 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 448 aa  84  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  25.4 
 
 		 399 aa  80.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  23.11 
 
 		 646 aa  80.5  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  28.86 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  32.16 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 427 aa  77.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  20.73 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  30.14 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  29.79 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  31.82 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  30.23 
 
 		 666 aa  74.3  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  28.73 
 
 		 657 aa  74.3  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  34.92 
 
 		 442 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  30.5 
 
 		 459 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  32.09 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  25.17 
 
 		 671 aa  69.3  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  38.83 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  30.97 
 
 		 479 aa  67.4  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  36.25 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  36.25 
 
 		 477 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  36.25 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  35 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  33.75 
 
 		 477 aa  57.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  39.78 
 
 		 257 aa  57.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  33.75 
 
 		 477 aa  57.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  30.71 
 
 		 1048 aa  57  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  42.31 
 
 		 325 aa  56.2  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 256 aa  55.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.41 
 
 		 210 aa  53.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.11 
 
 		 303 aa  52.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  38.96 
 
 		 174 aa  52.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 271 aa  51.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 318 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  27.01 
 
 		 421 aa  50.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.21 
 
 		 210 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  39.08 
 
 		 300 aa  48.1  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  51.02 
 
 		 202 aa  48.1  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  45.76 
 
 		 523 aa  47.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  33.04 
 
 		 208 aa  47.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 535 aa  47.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  43.1 
 
 		 257 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  29.13 
 
 		 265 aa  47.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  35.37 
 
 		 370 aa  47.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  31.19 
 
 		 295 aa  46.2  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.56 
 
 		 261 aa  46.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  28.15 
 
 		 170 aa  46.2  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  40 
 
 		 169 aa  45.8  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  31.11 
 
 		 419 aa  45.8  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  31.71 
 
 		 286 aa  45.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>