More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4966 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  43.94 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  41.86 
 
 		 370 aa  94.4  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  33.8 
 
 		 295 aa  87.8  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  39.69 
 
 		 424 aa  84.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  32.1 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  33.56 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  33.1 
 
 		 242 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  33.78 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 285 aa  77.8  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  32.89 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  36.15 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  32.39 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  33.59 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  34.88 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  32.28 
 
 		 532 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  36.84 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  30.9 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  29.21 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  33.59 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  35.25 
 
 		 303 aa  74.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 246 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  33.33 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  33.57 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  33.57 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  30.67 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 256 aa  74.3  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 208 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  29.59 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  34.92 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  34.97 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  31.97 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  36.76 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  31.01 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  32.59 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  32.59 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  31.43 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  30.71 
 
 		 532 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  27.98 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  32.91 
 
 		 150 aa  72  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  32.59 
 
 		 226 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 255 aa  72  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  33.59 
 
 		 342 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  29.03 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 298 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  38.67 
 
 		 259 aa  70.9  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.85 
 
 		 261 aa  70.9  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  36.43 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  43.53 
 
 		 1048 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  25.48 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  28.76 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  36.36 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  25.48 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  36.46 
 
 		 556 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  28.68 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  33.07 
 
 		 384 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  29.37 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  31.65 
 
 		 458 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  32.59 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  29.82 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 450 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  27.61 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  26.99 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  29.17 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  30.81 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  32.19 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  27.33 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  33.61 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 257 aa  67.4  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  32.77 
 
 		 221 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  30.59 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  32.03 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>