More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0721 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  100 
 
 
202 aa  413  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_002950  PG0740  NLP/P60 family protein  52.52 
 
 
189 aa  154  9e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  35.53 
 
 
168 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  35.97 
 
 
181 aa  98.6  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  37.59 
 
 
232 aa  91.3  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
302 aa  89.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  35.82 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  36.29 
 
 
186 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  30.17 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  34.38 
 
 
207 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  36.97 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  33.62 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  33.55 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  31.82 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  39.02 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  34.31 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  35.85 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
424 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  31.58 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  33.58 
 
 
333 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  35.9 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  33.58 
 
 
333 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  31.5 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  32.85 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  33.58 
 
 
333 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  30.67 
 
 
333 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  32.85 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  32.85 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  30.67 
 
 
333 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  30 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  27.78 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  35.37 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  32.85 
 
 
333 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  29.03 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  34.15 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  36.13 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  30.08 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  31.39 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  31.54 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  29.19 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  29.19 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  31.5 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.96 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  36.72 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.03 
 
 
391 aa  72.4  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  30.19 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  34.35 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  36.96 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  33.85 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  33.86 
 
 
303 aa  72  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  33.04 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  30.53 
 
 
285 aa  72  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  32.43 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  31.41 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  36.25 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  30.95 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  29.6 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  37.35 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  32.82 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  40.26 
 
 
298 aa  68.6  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  30.47 
 
 
385 aa  68.2  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.2 
 
 
332 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  31.62 
 
 
246 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  37 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  34.62 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  28.99 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  29.17 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0007  nlp/p60 family protein  27.06 
 
 
380 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  29.07 
 
 
257 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  34.09 
 
 
532 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  35.94 
 
 
159 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  30.13 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  27.86 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  34.44 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  32.48 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  30.88 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  34.62 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  34.62 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  34.62 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  34.62 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  34.62 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  35.45 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  31.39 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  32.81 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  30.4 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  37.17 
 
 
532 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.23 
 
 
1048 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  31.85 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  33.87 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  35.09 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  34.06 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  31.85 
 
 
342 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  30.46 
 
 
349 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  31.93 
 
 
143 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>