More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2523 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  42.08 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  43.94 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 168 aa  99  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 319 aa  93.2  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  34.36 
 
 		 295 aa  89.4  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  40 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  33.53 
 
 		 217 aa  87  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  31.97 
 
 		 232 aa  84.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  34.57 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  33.68 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  33.86 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  31.22 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  29.78 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  31.43 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  27.78 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_002950  PG0740  NLP/P60 family protein  28.17 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  27.96 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  36.72 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  27.96 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  28.19 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  27.96 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  27.96 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  27.96 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  27.96 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  27.96 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  36.07 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  28.42 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  29.26 
 
 		 404 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  32.54 
 
 		 370 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  30.14 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  27.66 
 
 		 353 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 		 372 aa  75.1  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 418 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  30.6 
 
 		 298 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.06 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  27.17 
 
 		 407 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  28.42 
 
 		 363 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  28.42 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  28.42 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  27.13 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  27.81 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  27.37 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  34.88 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 450 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  28.98 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  33.9 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  36.57 
 
 		 274 aa  71.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  33.07 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  29.3 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  30.07 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  33.59 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  30.07 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  29.35 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  36.67 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  36.07 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  34.11 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  47.62 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  40.48 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0124  NLP/P60 family protein  31.15 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  28.48 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  34.17 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  40 
 
 		 256 aa  67.8  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  35 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  32.68 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  37.9 
 
 		 303 aa  67  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  31.16 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  32.28 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  34.48 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  29.69 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  31.5 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  34.71 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  31.39 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  31.18 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  35.34 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 338 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  31.9 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>