More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2940 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  38.46 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  35.1 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  34.93 
 
 		 168 aa  88.6  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  33.57 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  33.53 
 
 		 189 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  33.57 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  34.09 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  37.8 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  37.12 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  35.48 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  37.8 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  51.47 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  36.22 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  30.77 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.18 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.11 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.84 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  34.92 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.71 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  28.87 
 
 		 1048 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2022  NLP/P60 family protein  35.14 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  34.23 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  34.23 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  36.97 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  34.23 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.24 
 
 		 318 aa  75.1  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  34.23 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  34.23 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  29.61 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  31.36 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 532 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  31.29 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  35.71 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  35.77 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  39.37 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  37.33 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  36.13 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  36.13 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  34.62 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  35.71 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  36.77 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  36.15 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  31.61 
 
 		 536 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  34.62 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  35.29 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 168 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  35.29 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  35.29 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  35.29 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  32.12 
 
 		 342 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  35.29 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  36.8 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  35.29 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.12 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  34.35 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  31.67 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  32.41 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  29.35 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  52.17 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  30.16 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  31.06 
 
 		 556 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  32.26 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  34.03 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  35.06 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  32.87 
 
 		 532 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  30.37 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  34.16 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  36 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>