34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1304 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  98.53 
 
 		 477 aa  982    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  97.69 
 
 		 477 aa  974    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  97.9 
 
 		 478 aa  978    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  98.11 
 
 		 477 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 477 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  40.2 
 
 		 519 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 531 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  40.6 
 
 		 532 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  29.94 
 
 		 459 aa  190  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  34.58 
 
 		 459 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  34.25 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  34.02 
 
 		 457 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  30.59 
 
 		 657 aa  159  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  28.93 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  32.33 
 
 		 461 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  28.73 
 
 		 421 aa  149  9e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  30.7 
 
 		 666 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  31.85 
 
 		 671 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  26.22 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  27.94 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  28.34 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  29.83 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  28.82 
 
 		 646 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  27.41 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  27.72 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  27.68 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  25.5 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  27.05 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  21.74 
 
 		 459 aa  62  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 1101 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  27.91 
 
 		 216 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  35.79 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>