More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5119 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5119  NLP/P60 protein  100 
 
 
387 aa  777    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.553866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  35.81 
 
 
208 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  45.87 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  33.74 
 
 
207 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.95 
 
 
222 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  35.57 
 
 
208 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.85 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.85 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
208 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  48.31 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  33.54 
 
 
532 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.14 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  41.32 
 
 
202 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  38.17 
 
 
536 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.51 
 
 
205 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  40.68 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.25 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  35.48 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
194 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  39.46 
 
 
187 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  37.06 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.74 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  40.5 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  36.13 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  38.21 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
150 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  39.69 
 
 
201 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  38.35 
 
 
242 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.46 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40.59 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  31.91 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  32.28 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.5 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  35.09 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.43 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  38.05 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  38.05 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  37.04 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  35.07 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  33.55 
 
 
234 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  33.55 
 
 
234 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
231 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
183 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  33.55 
 
 
218 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  33.55 
 
 
218 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  33.55 
 
 
234 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  33.55 
 
 
218 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  33.55 
 
 
218 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  37.17 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  37.17 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  37.17 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  37.17 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  37.17 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  34.06 
 
 
224 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  33.13 
 
 
476 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  37.17 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  37.17 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  37.17 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  37.17 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  40.4 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  40.4 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  34.46 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  40.4 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  40.4 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  34.92 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  40.4 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  34.78 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  40.66 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  39.53 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  34.78 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  33.05 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  34.06 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  39.53 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  37 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  39.53 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  35.65 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  39.53 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  42.22 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  34.78 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  39.53 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  39.53 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  37.07 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  34.06 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  50 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  39.53 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  34.06 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.44 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  34.91 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  40 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>