62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2082 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  730    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  68.31 
 
 
339 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  52.4 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  71.3 
 
 
317 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  52.91 
 
 
452 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.78 
 
 
438 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  50.34 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  51.13 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  48.09 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  41.94 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  52.63 
 
 
322 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  52 
 
 
294 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  46.72 
 
 
357 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  47.33 
 
 
303 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  46.09 
 
 
349 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  38.71 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.13 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  46.9 
 
 
1048 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  31.87 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  34.56 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  34.64 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  40.62 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  41.24 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  34.43 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  30.49 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  39.36 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  33.61 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  33.61 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  39.18 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  44.05 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.89 
 
 
547 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.54 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.39 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  34.02 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  34.38 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  35.25 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  37.78 
 
 
291 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  36.36 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  36.36 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  38.32 
 
 
216 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  38.83 
 
 
220 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
366 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  32.32 
 
 
682 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  36.89 
 
 
251 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  36.89 
 
 
251 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  36.89 
 
 
251 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  42.86 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  37.04 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  31.43 
 
 
767 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  37.5 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  34.62 
 
 
171 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  34.62 
 
 
171 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  32.03 
 
 
320 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  39.74 
 
 
199 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  39.74 
 
 
201 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  39.74 
 
 
201 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  33.04 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  28.76 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  32.91 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  32.91 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  32.91 
 
 
365 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>