54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0930 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  733    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  56.77 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  38.87 
 
 
339 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  38.69 
 
 
317 aa  205  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  32.92 
 
 
336 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  40.95 
 
 
324 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  35.79 
 
 
294 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  31.07 
 
 
303 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  36.21 
 
 
340 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  34.26 
 
 
324 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  31.72 
 
 
322 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  46.72 
 
 
364 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  30.74 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  26.5 
 
 
358 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  27.52 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  27.13 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.46 
 
 
554 aa  90.5  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  27.74 
 
 
338 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  24.42 
 
 
300 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.26 
 
 
547 aa  87  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  24.73 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  43.75 
 
 
1048 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  25.49 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  24.51 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  43.82 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  37.61 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  31.01 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  28.3 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  34.44 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  39.02 
 
 
291 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.45 
 
 
288 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  33.33 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  33.33 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  34.13 
 
 
220 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  41.25 
 
 
251 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  41.25 
 
 
251 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  41.25 
 
 
251 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  31.58 
 
 
682 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  40 
 
 
256 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  26.76 
 
 
306 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  26.29 
 
 
342 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  37.35 
 
 
171 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  37.35 
 
 
171 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.86 
 
 
321 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  31.21 
 
 
320 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 
767 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  27.97 
 
 
1050 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  31.82 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  30.22 
 
 
220 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  35 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  27.8 
 
 
361 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  27.8 
 
 
361 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  27.27 
 
 
370 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>